Bác sĩ có thể khuyên bệnh nhân chụp CT để cung cấp hình ảnh chi tiết về nhiều loại mô, bao gồm phổi, xương, mô mềm và mạch máu. Nếu bị đột quỵ, chụp CT có thể giúp phát hiện vị trí tắc nghẽn hoặc chảy máu trong não là nguyên nhân của cơn đột quỵ đó. Chụp CT cũng cho phép bác sĩ phát hiện cả cấu trúc bình thường và cấu trúc bất thường một cách chính xác mà không cần xâm lấn và không gây đau.
Chụp CT hỗ trợ việc lên phương án và chuẩn bị cho một số loại phẫu thuật nhất định bao gồm mở sọ thức tỉnh (phẫu thuật não để loại bỏ tổn thương não) và phẫu thuật kích thích não sâu. Chụp CT cũng hữu ích trong việc lên phương án và hướng dẫn xạ trị (điều trị ung thư), sinh thiết kim và các quy trình phẫu thuật xâm lấn tối thiểu khác.