MRI 可提供身体软组织的影像，例如心脏、肺、肝和其他使用 X 射线检查无法清楚呈现的器官。MRI 也可帮助医生评估您的许多器官的结构和功能。您的医生可能会建议您接受 MRI 扫描以诊断和评估脑动脉瘤或脑肿瘤因为它可提供有关该脑病变类型的临时诊断。此外，如果您发生中风，MRI 扫描可找出大脑中造成中风的血管阻塞或出血位置。它也可提供诊断测试，以检查癫痫发作的结构性原因。
MRI 扫描可在 X 射线血管造影之外提供另一种诊断心脏病和脑部疾病的更安全且非侵入性的选择，并可用来检测和评估软组织、关节和脊椎的损伤。這项扫描也可帮助医生计划和准备某些手术，包括清醒开颅术（切除大脑病变的脑部手术）和深层脑部刺激手术。