大多数功能性卵巢囊肿会随着时间的推移自行消失。如果您患有的功能性囊肿引起了一些症状，那么您的医生可能会根据你的情况采用一些保守的治疗方法，比如非处方药。
如果出现下列情况，您的医生可能会建议您接受卵巢囊肿切除术：
- 几次经期后都不会消失
- 变得更大
- 超声波扫描图显示异常
- 引起疼痛
囊肿可能会生长、扭转（可能非常疼痛）、破裂（腹部可能会有大量血液）或缩小消失。囊肿可能是良性的，也可能是癌性的。
请咨询您的妇科医生，以寻求根据个人病情给出的建议治疗方法。一些接受腹腔镜囊肿切除术的患者甚至可以在当天回家。